日本雖然受到金融危機的直接影響較小，但間接影響較大。2008年第二和第三季度日本GDP已連續兩個季度出現負增長，經濟明顯陷入衰退局面。其主要原因是受金融危機影響，日本對美國出口減少，同時，新興經濟體經濟增長放緩，對日本產品需求也減少。

　　這對日本的出口依賴型經濟構成很大沖擊。由于金融危機尚未見底且不斷蔓延，歐美和新興經濟體的經濟狀況繼續惡化可能性較大，外部需求的進一步降低將導致日本出口繼續減少，同時，國內企業利潤下降以及出于對經濟下行擔憂而減少投資和消費都將導致國內需求萎縮，預計日本經濟恢復將慢于歐美。

　　日本日興資產管理公司大中華區總裁宮里啟暉在接受記者訪問時表示，一方面由于日本的金融機構也持有來自美國為數不少的金融衍生產品，投資者對其不再信賴而導致這些機構的股價大幅度下跌；另一方面，金融危機向全球蔓延，美元和歐元雙雙貶值、日元急劇升值、股市大幅下挫將進一步導致日本經濟下滑。

　　宮里說，日本國民大量的金融資產中有相當一部分是美元資產、是用美元計價的，因此美元越貶值其損失也越大，最終會影響消費支出；另外，日本和美國金融機構的利率差是日本國民投資美元資產的直接動因，如果美國經濟長期低迷下去，利差將會消失，資金就會回流日本，迫使日元升值美元貶值，并導致企業出口惡化而重創日本經濟。

　　另外，從日本的經濟結構來看，2005年至2006年間日本在海外的利息收入和投資收益已超過貿易盈余，日本其實已是一個投資國，而最大的投資地是美國，美國出現問題，對日本的潛在影響無法估量，可能會迫使日本改變增長方式，用擴大內需保持經濟增長。但日本社會人口減少、老齡化問題越來越嚴重，政府債臺高筑，能否擴大內需很難預料。

　　金融危機導致日本經濟衰退，日本政府將參考美國的救援方式，必要時將采取措施拯救日本的支柱產業，例如汽車業等。而國內能源嚴重依賴進口的日本，在考慮長遠戰略需要的同時，大幅降低對傳統能源的依賴，開發新能源。日本有專家甚至信心十足地提出，日本從能源進口大國轉變為能源輸出大國不再是夢想，日本已經在不知不覺中晉身為新能源大國的行列了。